Le réseau de sites de référence Excellence Gers s’appuie sur le fonctionnement de deux commissions :

- Commission Cahier des charges : elle valide les cahiers des charges et les protocoles d’accord (convention qui fixe les engagements réciproques entre la filière ou l’entreprise et l’Association Excellence Gers)

- Commission Contrôle : elle garantit la crédibilité et la pérennité de la démarche. La confidentialité et l’impartialité sont des engagements pris par chacun des membres. Sa mission principale est de valider la qualification des sites, et de veiller au suivi de la qualification.

     Les commissions sont composées de représentants des chambres consulaires, des filières, et des associations de consommateurs. Elles se réunissent plusieurs fois par an pour étudier les différents dossiers (demande de qualification...).

     L’Association Excellence Gers a défini un plan de contrôle et de suivi (contrôles internes et contrôles externes) pour garantir la démarche et le respect des cahiers des charges.

     Un organisme de contôle indépendant réalise des contrôles "externes" au niveau de l'Association Excellence Gers, des sites qualifiés et de leur structure référente.